二零二四年六月的天氣特徵是上半月普遍較多雲及有驟雨。隨著西北太平洋的副熱帶高壓脊向西伸展並覆蓋中國東南部，下半月本港普遍晴朗並出現高溫天氣。當中六月二十日至二十八日連續九日出現酷熱天氣，是六月份其中一個最長紀錄。整體而言，全月較正常多雲。六月平均雲量為百分之86，較正常值的百分之77高百分之9。六月總日照時間為116.3小時，較正常值的144.3小時低約百分之19。六月亦較正常熱，平均氣溫為28.8度，較正常值的28.3度高0.5度。由於二零二四年上半年有五個月較正常暖，上半年本港異常溫暖。上半年平均最低氣溫21.4度、平均氣溫23.3度及平均最高氣溫25.8度，分別是有記錄以來同期的最高、其中一個最高及第二高。縱使六月上半月普遍較多雲及有驟雨，全月總雨量為281.3毫米，較正常值的491.5毫米少約百分之43。上半年累積的雨量為863.4毫米，較同期正常值的1082.5毫米少約百分之20。

熱帶風暴馬力斯於六月一日清晨在廣東陽江登陸。馬力斯其後橫過廣東內陸，並於黃昏逐步減弱為低壓區。馬力斯的外圍雨帶於六月一日為本港帶來狂風大驟雨。本港普遍錄得超過30毫米雨量，而荃灣及沙田的雨量更超過80毫米。受一股西南氣流影響，六月二日部分時間有陽光及有幾陣驟雨。

在南海西北部徘徊的一道低壓槽於六月三日至七日為本港帶來幾陣驟雨。而受一股達強風程度的偏東氣流影響，六月三日至四日風勢較大。在有雨的情況下，天文台氣溫於六月四日下降至全月最低的22.9度。隨著低壓槽移近珠江口，六月八日至九日雨勢較大及有幾陣雷暴。在這兩天，本港多處錄得超過50毫米雨量，而葵青、荃灣及西貢區的雨量更超過100毫米。

在一股偏南氣流影響下，六月十日至十三日本港天氣夾雜短暫陽光、驟雨及雷暴。六月十一日早上荃灣及葵青區有大驟雨，錄得超過70毫米雨量。受一股活躍的西南季候風影響，六月十四日至十六日本港天氣轉壞並出現連場大雨。在這三天，本港多處錄得超過80毫米雨量，而北區、大埔及荃灣區的雨量更超過200毫米。六月十四日的大雨令天文台需要發出紅色暴雨警告。當日本港境內錄得超過4000次雲對地閃電。六月十五日天文台曾三度發出黃色暴雨警告。當日下午流浮山曾錄得每小時超過110公里的猛烈陣風。

隨著西北太平洋的副熱帶高壓脊逐漸向西伸展，六月十七日至十九日本港天氣好轉，短暫時間有陽光。同時，受一股偏南氣流影響，本港仍有幾陣驟雨，局部地區有雷暴。在副熱帶高壓脊的支配下，除有幾陣驟雨及局部地區有雷暴外，六月二十日至二十八日本港日間部分時間有陽光，天氣酷熱。六月二十一日錄得最高氣溫34.0度及平均氣溫30.8度，均是有記錄以來夏至的其中一個最高。此外，六月二十二日最低氣溫29.5度，是有記錄以來六月份的其中一個最高。在陽光充沛的情況下，天文台氣溫於六月二十七日上升至全月最高的34.4度。六月二十八日下午港島以西海域曾出現水龍捲。受位於南海東北部的熱帶擾動及隨後的西南氣流影響，六月最後兩天本港天氣夾雜短暫陽光、驟雨及狂風雷暴。在這兩天，荃灣及西貢區部分地方的雨勢特別大，錄得超過60毫米雨量。